Form 1 NLM NCBI CDDS Survey Instrument

CCDS User Survey

OMB Control Number: 0925­0648
Expiration Date: 03/31/2018
Public reporting burden for this collection of information is estimated to average 5 minutes per response,
including the time for reviewing instructions, searching existing data sources, gathering and maintaining the
data needed, and completing and reviewing the collection of information. An agency may not conduct or
sponsor, and a person is not required to respond to, a collection of information unless it displays a
current valid OMB control number. Send comments regarding this burden estimate or any other aspect of
this collection of information, including suggestions for reducing this burden, to NIH, Project clearance
Branch, 6705 Rockledge Drive, MSC 7974, Bethesda, MD 20892­7974, ATTN: PRA (0925­0648). Do not
return the completed form to this address.
____________________________________________________________________

1. Which category describes you best?
Lab director
Genetic counselor
Medical geneticist
Pathologist
Other type of physician
Researcher

Student
Bioinformatician
Data analyst
Other (please specify)

2. What category describes your organization best?
Academic Institution
Government
Research Institute
Other non­profit
Medical or Clinical
Corporate or for­profit
Other (please specify)

3. The CCDS project data is available from several web and ftp sites. How do you access
CCDS data?
NCBI Gene resource or genome browser
NCBI CCDS web site
NCBI CCDS FTP site
UCSC genome browser
UCSC download
Ensembl genome browser
Ensembl API/download
GENCODE FTP site
Other (please specify)

4. What is your species of interest in the CCDS database?
Human
Mouse
Human and Mouse

5. How often do you use CCDS Data?
Every day
Several times a week
Several times a month
About once a month
Less than once a month
This is my first visit

6. In a month, about how much do you spend working with CCDS data?
Less than an hour
1­10 hours
More than 10 hours

7. What do you use CCDS data for?
Experimental design
Data analysis
Interpretation of results
Preparing a manuscript or grant proposal
Preparing a commercial product
Providing a CCDS cross­reference on a website
Other (please specify)

8. What are the main reasons for your interest in the CCDS database?

It represents a set of genomic coordinates annotated identically in RefSeq and Ensembl databases
It represents high quality protein sequences that are annotated identically in RefSeq and Ensembl
databases
It represents high quality protein sequences, given that a significant portion of CCDS data is manually
curated
It is a restricted dataset of canonical protein annotations
I prefer CCDS data over the data in its component databases (RefSeq and Ensembl)
I was not aware of these facts about the CCDS database, but I use it anyway.
Other (please specify)

9. The CCDS resource uses a set of guidelines to make collaborative annotation decisions,
available to the public
at: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/CCDS/docs/CCDS_curation_guidelines.pdf
Are you familiar with these guidelines?
Yes
No

10. If you answered yes, were these guidelines useful to you?
Yes
No
Any comments?

11. How important is the CCDS database to your work?
Required for my work
Very important
Moderately important
Slightly important
Not at all important

12. If CCDS did not exist, would you have been able to recreate CCDS yourself?
Yes
No

13. If you had to recreate these data yourself, approximately how much time would it have
taken you to do so?
A week or less
More than a week, up to a month
More than a month, up to a year
More than a year

14. New CCDS releases are available for human and mouse about once each year. How
often would you like to see new CCDS releases?
Satisfied with once a year
Twice a year
More frequently

15. How easy was it to find what you were looking for in the CCDS resource?
Extremely easy
Very easy
Somewhat easy
Not so easy
Not at all easy

16. How easy is it to understand the information in the CCDS resource?
Extremely easy
Very easy
Somewhat easy
Not so easy
Not at all easy

17. Overall, how satisfied are you with the CCDS resource?
Extremely satisfied
Very satisfied
Moderately satisfied
Slightly satisfied
Not at all satisfied

18. What would make you more likely to use the CCDS resource?

19. Do you have suggestions about improving the current content and about any
additional content that you would like in the CCDS resource? Please enter your comments
in the box below.

20. How likely is it that you would recommend the CCDS resource to a friend or colleague?
Not at all likely
0

1

Extremely likely
2

3

4

5

Done

6

7

8

9

10